Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms