Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Pde6cQ91ZQ1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6cQ91ZQ1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Pde6cQ91ZQ1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6cQ91ZQ1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Pde6cQ91ZQ1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6cQ91ZQ1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6cQ91ZQ1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Pde6cQ91ZQ1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6cQ91ZQ1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6cQ91ZQ1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Pde6cQ91ZQ1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Pde6cQ91ZQ1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6cQ91ZQ1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6cQ91ZQ1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6cQ91ZQ1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6cQ91ZQ1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Pde6cQ91ZQ1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6cQ91ZQ1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6cQ91ZQ1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms