Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Vmn1r72Q8K3N7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r72Q8K3N7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r72Q8K3N7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r72Q8K3N7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r72Q8K3N7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r72Q8K3N7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r72Q8K3N7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Vmn1r72Q8K3N7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Vmn1r72Q8K3N7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Vmn1r72Q8K3N7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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