Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6aQ78XR0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trappc6aQ78XR0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trappc6aQ78XR0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trappc6aQ78XR0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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