Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms