Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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