Protein–RNA interactions for Protein: Q61268

Apoc4, Apolipoprotein C-IV, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc4Q61268 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Apoc4Q61268 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Apoc4Q61268 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms