Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFR0

Pabpn1l, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1lQ5XFR0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpn1lQ5XFR0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpn1lQ5XFR0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpn1lQ5XFR0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpn1lQ5XFR0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpn1lQ5XFR0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpn1lQ5XFR0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpn1lQ5XFR0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpn1lQ5XFR0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpn1lQ5XFR0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpn1lQ5XFR0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpn1lQ5XFR0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpn1lQ5XFR0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpn1lQ5XFR0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpn1lQ5XFR0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpn1lQ5XFR0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpn1lQ5XFR0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpn1lQ5XFR0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpn1lQ5XFR0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpn1lQ5XFR0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpn1lQ5XFR0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpn1lQ5XFR0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpn1lQ5XFR0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms