Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brip1Q5SXJ3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms