Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms