Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Cops9Q3U898 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms