Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms