Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LtbP41155 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LtbP41155 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LtbP41155 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbP41155 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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LtbP41155 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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LtbP41155 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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LtbP41155 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbP41155 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbP41155 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbP41155 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbP41155 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbP41155 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbP41155 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbP41155 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbP41155 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbP41155 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbP41155 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbP41155 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbP41155 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbP41155 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbP41155 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbP41155 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbP41155 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbP41155 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbP41155 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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