Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcdP28867 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcdP28867 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcdP28867 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcdP28867 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcdP28867 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcdP28867 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcdP28867 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcdP28867 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcdP28867 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcdP28867 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcdP28867 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcdP28867 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PrkcdP28867 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcdP28867 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcdP28867 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PrkcdP28867 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PrkcdP28867 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcdP28867 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcdP28867 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcdP28867 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PrkcdP28867 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PrkcdP28867 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcdP28867 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcdP28867 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms