Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klra1P20937 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms