Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms