Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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