Protein–RNA interactions for Protein: O70194

Eif3d, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3dO70194 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3dO70194 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms