Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms