Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkbO70126 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkbO70126 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkbO70126 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms