Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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