Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NmiO35309 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NmiO35309 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NmiO35309 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NmiO35309 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NmiO35309 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NmiO35309 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NmiO35309 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NmiO35309 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NmiO35309 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NmiO35309 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NmiO35309 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NmiO35309 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NmiO35309 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NmiO35309 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NmiO35309 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NmiO35309 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NmiO35309 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NmiO35309 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NmiO35309 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NmiO35309 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NmiO35309 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NmiO35309 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NmiO35309 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NmiO35309 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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NmiO35309 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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NmiO35309 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmiO35309 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NmiO35309 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NmiO35309 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NmiO35309 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NmiO35309 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NmiO35309 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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NmiO35309 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NmiO35309 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NmiO35309 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NmiO35309 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NmiO35309 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NmiO35309 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NmiO35309 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NmiO35309 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NmiO35309 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NmiO35309 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NmiO35309 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NmiO35309 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NmiO35309 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NmiO35309 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NmiO35309 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NmiO35309 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NmiO35309 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NmiO35309 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NmiO35309 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NmiO35309 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NmiO35309 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NmiO35309 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NmiO35309 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NmiO35309 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NmiO35309 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NmiO35309 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NmiO35309 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NmiO35309 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NmiO35309 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NmiO35309 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NmiO35309 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NmiO35309 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NmiO35309 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NmiO35309 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NmiO35309 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NmiO35309 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms