Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms