Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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H2-Q1O19441 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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H2-Q1O19441 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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H2-Q1O19441 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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H2-Q1O19441 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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H2-Q1O19441 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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H2-Q1O19441 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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H2-Q1O19441 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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H2-Q1O19441 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Q1O19441 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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H2-Q1O19441 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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