Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r167G3UW71 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms