Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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