Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms