Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1aA2APX8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms