Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms