Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms