Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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