Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc91Q9D8L5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms