Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms