Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms