Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms