Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX5

Cldnd1, Claudin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd1Q9CQX5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldnd1Q9CQX5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd1Q9CQX5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd1Q9CQX5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd1Q9CQX5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd1Q9CQX5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd1Q9CQX5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd1Q9CQX5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd1Q9CQX5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd1Q9CQX5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd1Q9CQX5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd1Q9CQX5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd1Q9CQX5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd1Q9CQX5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd1Q9CQX5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd1Q9CQX5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd1Q9CQX5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd1Q9CQX5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd1Q9CQX5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms