Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rab5aQ9CQD1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rab5aQ9CQD1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rab5aQ9CQD1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rab5aQ9CQD1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms