Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Smim11aQ99J19 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Smim11aQ99J19 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Smim11aQ99J19 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Smim11aQ99J19 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Smim11aQ99J19 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Smim11aQ99J19 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Smim11aQ99J19 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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