Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms