Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc58Q8R3Q6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc58Q8R3Q6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc58Q8R3Q6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ccdc58Q8R3Q6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ccdc58Q8R3Q6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ccdc58Q8R3Q6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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