Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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CLDN19Q8N6F1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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CLDN19Q8N6F1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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CLDN19Q8N6F1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CLDN19Q8N6F1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CLDN19Q8N6F1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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CLDN19Q8N6F1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN19Q8N6F1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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