Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms