Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E4f1Q8CCE9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E4f1Q8CCE9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E4f1Q8CCE9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E4f1Q8CCE9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E4f1Q8CCE9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E4f1Q8CCE9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
E4f1Q8CCE9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E4f1Q8CCE9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E4f1Q8CCE9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E4f1Q8CCE9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E4f1Q8CCE9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E4f1Q8CCE9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E4f1Q8CCE9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E4f1Q8CCE9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E4f1Q8CCE9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E4f1Q8CCE9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E4f1Q8CCE9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E4f1Q8CCE9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E4f1Q8CCE9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E4f1Q8CCE9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E4f1Q8CCE9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E4f1Q8CCE9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E4f1Q8CCE9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms