Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cnpy4Q8BQ47 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cnpy4Q8BQ47 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cnpy4Q8BQ47 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cnpy4Q8BQ47 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cnpy4Q8BQ47 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cnpy4Q8BQ47 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms