Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra5Q8BHJ7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra5Q8BHJ7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms