Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms