Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms