Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6DFW0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6DFW0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6DFW0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6DFW0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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