Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2a3Q64518 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms