Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms